More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6703 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 133 aa  276  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  39.67 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  40.5 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  38.98 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  35.83 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.96 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  37.96 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  37.96 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  37.96 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  34.17 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.54 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  37.23 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  37.23 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  37.23 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  37.23 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  37.23 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  37.23 
 
 		 220 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  34.95 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  31.63 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4158  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 118 aa  66.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  34.74 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>