More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3740 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 127 aa  266  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  62.07 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  57.94 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  40.35 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  46.6 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  42.72 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  39.81 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  39.42 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  38.46 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  38.98 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  37.86 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  42.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  42.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  39.78 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  38 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  32.73 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  32.73 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>