More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0941 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 134 aa  273  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  59.63 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  51.26 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  56.73 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  52.99 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  53.77 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  50.43 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  51.35 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  47.2 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  50.44 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  50.46 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  47.27 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  47.17 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  43.22 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.39 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  47.87 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  47.83 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  44.57 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  44.57 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  44.57 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  46.74 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46.74 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43.48 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  44.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  43.16 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  45.65 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  45.65 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  37.38 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  43.16 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  37.11 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  33.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  41.57 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  44.9 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>