More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0075 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 129 aa  268  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  46.43 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  50.96 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  45.92 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 112 aa  95.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  43 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  43 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.62 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.62 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40.59 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.68 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47.25 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  40.59 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  41.41 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  45.56 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  38.71 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  45.98 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  49.43 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.74 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  40.23 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>