More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7246 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  53.93 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  41.58 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  51.04 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  46.94 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.3 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.3 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  46.51 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  42.72 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  51.16 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  43.56 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  43.56 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  43.56 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  42.57 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  43.3 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  48.89 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.57 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  47.78 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.78 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  47.78 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.58 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  43.53 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  39.82 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  46.59 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  40.59 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  40.59 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>