More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2289 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  66.36 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  66.37 
 
 		 113 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  54.37 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  55.77 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  48.11 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.62 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.62 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.45 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.68 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  44.68 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  44.68 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.09 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  39.09 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  45.92 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  37.74 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40.86 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 117 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 119 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>