More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1019 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  67.62 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  69.16 
 
 		 117 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  65.35 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  56.57 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  50.51 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 117 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  42.24 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  46.53 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 129 aa  94  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  41.3 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  41.3 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  41.3 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  36.11 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  39.58 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  41.3 
 
 		 220 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  37.07 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  34.95 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40.48 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>