More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2747 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  60.17 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  61.74 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  57.02 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  52.99 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  50.86 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  50.51 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  46.73 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  38.66 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 119 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  38.32 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  38.38 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  45.35 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  36.28 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  33.04 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40.45 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40.45 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  38.94 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  32.26 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  39.33 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  41.3 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>