More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1690 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  62.16 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  61.74 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  59.29 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  49.11 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  46.34 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  46.49 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  49.56 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  47.42 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  47.42 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  47.42 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  46.39 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.39 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  40.38 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  38.21 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  44.32 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  39.66 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  39.66 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47.25 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.97 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>