More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3738 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  44.14 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 117 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 118 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.05 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.05 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40.82 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 117 aa  87  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.78 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.78 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.78 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  38.66 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  43.88 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  43.88 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  43.88 
 
 		 220 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  43.88 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  43.88 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  43.88 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  43.88 
 
 		 206 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 111 aa  83.6  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  43.88 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40.18 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  38.37 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  36.44 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  36.89 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  37.63 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>