More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0906 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  225  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  63 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  62.5 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  63.64 
 
 		 116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  49.51 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  48.54 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  48.54 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  48.54 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  48.54 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  48.54 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  48.54 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  55 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.65 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.39 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44.57 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  44.05 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  42.53 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 230 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  36.96 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  36.96 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  41.11 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0916  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000825483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  34.74 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>