More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2498 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 114 aa  235  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  57.43 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  46.74 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  46.74 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  46.74 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  46.74 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  46.74 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  46.74 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40.19 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.42 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  43.56 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  41.94 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  41.94 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  41.94 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  91.3  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  43.43 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  39.56 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  45.56 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 117 aa  87  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 110 aa  85.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  42.55 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>