More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0952 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.89 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40.22 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  38.04 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.04 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.04 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.04 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.58 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.58 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  36.96 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  40.22 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  30.84 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  38.32 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>