More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4029 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  98.36 
 
 
122 aa  248  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  64.29 
 
 
124 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  53.49 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 
132 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.19 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.11 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  42.11 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  36.73 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  40 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
116 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.46 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  40.22 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  35.85 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  35.48 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  39.8 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3102  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  42.39 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  37.5 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  40.62 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.19 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  47.19 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  40 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.19 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>