More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1948 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
124 aa  256  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  63.11 
 
 
104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  61.17 
 
 
107 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  61.17 
 
 
107 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  63.92 
 
 
107 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  60.19 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 
120 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  56.12 
 
 
113 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  53.54 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 
135 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  44.76 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  45.54 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
98 aa  97.1  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  46.39 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  53.49 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 
110 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  46.46 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
218 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  43 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.89 
 
 
110 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
118 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.45 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  46.59 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  38.78 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  37.89 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  36.7 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  37.89 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  38.3 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  38.3 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  40.22 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  38.71 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  38.2 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  41.18 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  38.3 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  43.68 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  39.13 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  39.13 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  44.71 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  37.5 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  35.29 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>