More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0446 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  46.39 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0916  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000825483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  41.59 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  32.71 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  38.54 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  38.54 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.54 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  38.54 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.54 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 250 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  32.2 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  36.73 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  32.14 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  31.19 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  32.26 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  34.83 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  30.19 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  29.57 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  33.33 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  28.04 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  29.81 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  30.43 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  33.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  33.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  33.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  29.67 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  29.47 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  34.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  33.7 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  30.43 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>