More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2088 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  56.12 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  46.88 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  34.68 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  43.53 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.2 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  46.51 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.23 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  38.37 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36.45 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  42.35 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  39.08 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  38.89 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  42.35 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  37.19 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  40.7 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.11 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>