More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3534 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 121 aa  246  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  39.53 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2197  hypothetical protein  36.27 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2159  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  34 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  34 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  39.53 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  40.7 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  40.24 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  32.69 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  39.77 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  27.52 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  37.65 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  33.87 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  30.1 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  39.77 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.8 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  36.19 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  33.96 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  30.39 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  35.9 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>