More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6863 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  85.09 
 
 		 230 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  38.6 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  41.01 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  44.07 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  42.99 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.71 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.19 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 110 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 125 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  34.68 
 
 		 133 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  39 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5402  transcriptional regulator, HxlR family  32.2 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  40.18 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  38.61 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  32.41 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 152 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 101 aa  68.2  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  26.42 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3142  helix-turn-helix, HxlR type  36.61 
 
 		 115 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933421  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36 
 
 		 110 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  37 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 119 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  39.8 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 112 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 126 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  36.89 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  36.89 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  39.8 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.4 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>