More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2572 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  63.98 
 
 		 191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  62.82 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  62.82 
 
 		 173 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  58.79 
 
 		 169 aa  194  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  60.78 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  58.96 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 148 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 136 aa  101  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 140 aa  94.4  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40.29 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.1 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  37.66 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  36.24 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  43.88 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  43.88 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  43.88 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.34 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  40.21 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.18 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  36.36 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  36.28 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  36.75 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  39.18 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  34.68 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  37.11 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>