More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1032 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  71.37 
 
 
228 aa  328  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.26 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  44.44 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
215 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  40.39 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  35.62 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  37.91 
 
 
219 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  37.75 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.12 
 
 
239 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  33.81 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
233 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 
230 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  34.9 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  40.17 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 
133 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
118 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.95 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  36 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.89 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.43 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 
107 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
114 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
121 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  32.69 
 
 
136 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  30.1 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  35.09 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
117 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 
113 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
135 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
115 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
119 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
106 aa  67  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
120 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  35.71 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  34.62 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  35.71 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>