More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3230 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 233 aa  281  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  58.02 
 
 		 219 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  45.33 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  44.81 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  34.42 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  33.18 
 
 		 213 aa  95.5  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  30.05 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.73 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  33.81 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  36.45 
 
 		 107 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  25.45 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  30.05 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  35.51 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 110 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 115 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  30.28 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  34.58 
 
 		 107 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  35.51 
 
 		 107 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 107 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  35.51 
 
 		 107 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 152 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  37 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  37 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 118 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.2 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.2 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  31.86 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 106 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  36.56 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  32.32 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>