More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1947 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  52.09 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  50.24 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  48.1 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  34.74 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  32.71 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  29.81 
 
 		 250 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 238 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  43 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 110 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  43.09 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  39.81 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 113 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 110 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 111 aa  77  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  33.91 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 160 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  34.17 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  39.67 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 130 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 152 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 116 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 108 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 118 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 135 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  29.36 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  31.3 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  33.61 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  33.01 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>