More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2744 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
213 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  83.57 
 
 
213 aa  354  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
223 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
218 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 
222 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  36.98 
 
 
212 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
219 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
230 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  36.95 
 
 
226 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
233 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 
218 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
210 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
234 aa  98.2  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  44.72 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  51.65 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
237 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.89 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 
239 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  46.39 
 
 
191 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.81 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  39.58 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  35.29 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  38.54 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  32.04 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.9 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 
106 aa  72  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  37.84 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 
124 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  34.96 
 
 
159 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  33.68 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  34.34 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.15 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.55 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  39.09 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  35.19 
 
 
125 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  36.89 
 
 
150 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>