More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0947 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  45.3 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  51.92 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 168 aa  97.1  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 161 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 169 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.8 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  44.25 
 
 		 157 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43.36 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  42.62 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  42.42 
 
 		 188 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  38.79 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 187 aa  90.1  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 		 191 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  40.86 
 
 		 212 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  45.92 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 165 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  43.3 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 173 aa  85.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 209 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  84.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  41.41 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 213 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  40.4 
 
 		 193 aa  83.6  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 290 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  39.39 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  39.39 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 268 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 314 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 314 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>