More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2008 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 222 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  52.09 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  55.16 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  43.13 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  52.54 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  39.41 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  54.13 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  53.06 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 110 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.34 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  46.02 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  32.7 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  38.24 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  54.17 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  44.09 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  41.75 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 150 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  29.82 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  44.09 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  40.86 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  44.09 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.09 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  36.21 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  36.21 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  36.21 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  36.21 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  36.21 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  36.21 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  37 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  47.75 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>