More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0202 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  63.52 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  62.03 
 
 		 191 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  61.96 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  58.79 
 
 		 169 aa  194  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  58.75 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  55.07 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  40.87 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 148 aa  97.1  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 136 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  34.17 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  39.82 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 116 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  38.28 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  38.54 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  38.54 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  35.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  35.04 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  36.08 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  33.57 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  34.17 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.2 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  33.87 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.2 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.2 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  40.82 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.05 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>