More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2233 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  40.4 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  39.74 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  35.03 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  42.64 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  50.51 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  36.47 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  41.73 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  36.6 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  33.97 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  35.79 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 106 aa  74.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  35.79 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  35.79 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  35.79 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  32 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 137 aa  72  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  33.12 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  40.66 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  33.59 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  30.62 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  31.73 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  36.08 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  32.84 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  29.47 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  36.08 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  34.96 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  36.56 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  30.3 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>