More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6743 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 156 aa  319  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  47.45 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  56.44 
 
 		 136 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  48.54 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  33.78 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 187 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  45.36 
 
 		 191 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 173 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 239 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.62 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.62 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.62 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  36.27 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  40.35 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  36.27 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  40.35 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  40.35 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  40.35 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  39.47 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36.17 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  35.07 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  35.07 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0720  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0201705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  34.55 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  29.27 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  36.96 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  37.5 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>