More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2223 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 173 aa  350  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  93.06 
 
 		 173 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  66.26 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 169 aa  207  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  63.52 
 
 		 169 aa  205  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  59.15 
 
 		 191 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  58.58 
 
 		 187 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  57.35 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  42.2 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 147 aa  97.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  36.75 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  36.94 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  30.56 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  35.79 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  26.8 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  38.78 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  32.99 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  30.58 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  32.63 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 147 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  33.66 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  34 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  31.62 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  29.47 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  36.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  35.71 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>