More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6044 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  54.6 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  52.41 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  57.35 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  57.35 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  55.07 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  44.91 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  33.78 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  36.8 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 136 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 137 aa  90.9  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.09 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  36.94 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  35.65 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  32 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  32.14 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  32.14 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  32.26 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  34.34 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  30.82 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  33.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  32.81 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  34.34 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  34.82 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  29.61 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  31.3 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>