More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2067 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  55.38 
 
 		 136 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  47.45 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  43.56 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  36.8 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  33.68 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  33.65 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  32.04 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  35.9 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  30.56 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  33.01 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  30.21 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  32.67 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 168 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.46 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.46 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.46 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  32.29 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.46 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  32.63 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  30.61 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  32.98 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.79 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  35.42 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  34 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  32.63 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  30.48 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  27.93 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  29.47 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>