More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3099 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  46.72 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  50.44 
 
 		 191 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  47.52 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  35.43 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  39.64 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  38.66 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  33.03 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  35.38 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  33.86 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  35.78 
 
 		 268 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  35.09 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  35.78 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  33 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  31.19 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  35.42 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  30.63 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  32.63 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 310 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  31.86 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  28.57 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  29.84 
 
 		 193 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  31.58 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  31.58 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  30.53 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>