More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0341 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  37.67 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  36.12 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  35.94 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  34.6 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  34.95 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  36.1 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  41.32 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  34.38 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  33.19 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  32.77 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  29.38 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35 
 
 		 110 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  24.54 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  43.3 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  38.78 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  32.26 
 
 		 124 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 150 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 124 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 119 aa  72  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 119 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 112 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  36.57 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 111 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>