More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1101 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  89.19 
 
 		 148 aa  275  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  38.26 
 
 		 174 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  40.5 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  45.45 
 
 		 191 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 169 aa  95.9  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  46.15 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  39.32 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  39.32 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  40.82 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  32.71 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  35.79 
 
 		 212 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  33.87 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  38.14 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.74 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>