More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1519 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  38.28 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  38.76 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  36.41 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  36.49 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  36.62 
 
 		 213 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  32.85 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.53 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  32.23 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  31.46 
 
 		 246 aa  98.6  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 124 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  45.1 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  27.57 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  28.02 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  37.01 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  31.93 
 
 		 133 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  35.77 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 		 111 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  36.67 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 104 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  36.21 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 179 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  32.73 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  30.48 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 113 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 111 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  37.04 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  37.25 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  32.69 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>