More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2294 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  72.73 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 112 aa  90.5  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  47.96 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  43.81 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  40.38 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  42.27 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  43.16 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.38 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  41.05 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.74 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44.68 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  44.68 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  44.68 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  44.68 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44.68 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  35.58 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  33.98 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  29.9 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  38.95 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  34.02 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>