More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2054 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  64.29 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  66.36 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  51.64 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  51.72 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 357 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  46.39 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  35.45 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  39 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.62 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  40.22 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  40.22 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  40.22 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  40.91 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  41.84 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  41.84 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.24 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  40.22 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>