More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0265 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  52.34 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.42 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  33.65 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  39.78 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  32.29 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  30.39 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  34.58 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  30.53 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  34.74 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  34.74 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  34.74 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  34.74 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  34.74 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  35.71 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  41.3 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  41.3 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  30.39 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  41.3 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>