More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0368 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  28.42 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  32.22 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  31.33 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  29.41 
 
 
229 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  37.65 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.44 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  36.71 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  25.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  25.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0720  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0201705  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  32.22 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  34.41 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  34.41 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.27 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  31.18 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  29.9 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  31.18 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  34.44 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  30.3 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  29.07 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  29.07 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
218 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.26 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.26 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.26 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  29.59 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  32.95 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  32.95 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  32.95 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.26 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  32.58 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  32.95 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  32.63 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
165 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
216 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
230 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  32.22 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  31.19 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  32.97 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  22.92 
 
 
213 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>