More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0720 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0720  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0201705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  39.08 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.63 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  35.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  35.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  35.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  33.68 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  32.52 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  31.18 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  40.7 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  34.34 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  28.69 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  32.32 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  31.9 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  30.93 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  32.29 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.69 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  35.58 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  33.96 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  32.5 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  30.91 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  34.58 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  33 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  32 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>