More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1483 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  59.83 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  48.7 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  46.96 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.62 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.54 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  36.54 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  41.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  36.79 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  32.69 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  33.98 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  35.71 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 239 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  31.86 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  37.5 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.08 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  30.39 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  34.38 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  40.82 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  40.82 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>