More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4780 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 234 aa  251  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  50.24 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  40.19 
 
 		 226 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  44.72 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  43.44 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  45.26 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  31.39 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  35.44 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.73 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  29.11 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  30.7 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  34.74 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  37.8 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  35.87 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  32.73 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  32 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  36.61 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  48.05 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  35.87 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  35.87 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  35.87 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  31.13 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 143 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  30.53 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  26.19 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  32.32 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 130 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>