More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2326 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  35.62 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  34.45 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  45.67 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  29.63 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  36.3 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  39.2 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  33.52 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  37.1 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  39.77 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  32.26 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 107 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 110 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5402  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  37.89 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  38.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 101 aa  62  0.000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 121 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 111 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  33.09 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3142  helix-turn-helix, HxlR type  35.42 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933421  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  30 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  30 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 104 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 124 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 114 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>