More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5238 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  71.37 
 
 		 227 aa  328  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  37.26 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  39.13 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  40.1 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.1 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  35.1 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  44.17 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  35.59 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 118 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  38 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 107 aa  72  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  41.49 
 
 		 162 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 114 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  30.77 
 
 		 112 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  30.21 
 
 		 113 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  35.09 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  34.58 
 
 		 117 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.27 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  29.13 
 
 		 106 aa  67  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 125 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 120 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 112 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  31.73 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  36.67 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>