More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4850 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  38.65 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  50.46 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  53.06 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 112 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  32.71 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 119 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42.39 
 
 		 112 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 		 165 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 156 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 108 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 110 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  31.39 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  31.82 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 114 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 140 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  48.91 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  48.91 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 119 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 148 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 		 113 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  48.91 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 130 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  48.91 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 136 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  46.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  36.56 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  48.91 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  36.56 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.63 
 
 		 107 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  33.9 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>