More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5213 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  45.85 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5402  transcriptional regulator, HxlR family  47.09 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 		 107 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 106 aa  92.4  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 130 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 130 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 119 aa  90.5  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  50.55 
 
 		 113 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 106 aa  89.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  41.12 
 
 		 162 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  50.55 
 
 		 159 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 180 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  48.42 
 
 		 131 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 110 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 165 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  50.55 
 
 		 177 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 175 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  43.96 
 
 		 140 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 106 aa  85.9  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  85.5  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 126 aa  85.1  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 112 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  44.57 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  48.86 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 116 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  46.81 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  50.57 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  44.19 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  43.27 
 
 		 135 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  48.89 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 135 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 111 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.19 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  47.73 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  39.6 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>