More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0924 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  52.54 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  32.43 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 229 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  31.93 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  41.54 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  33.65 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  43.56 
 
 		 125 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  42.55 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  35.83 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 101 aa  68.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  29.27 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 125 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 		 152 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  39.09 
 
 		 164 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 132 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40.22 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.4 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  41.75 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  43.01 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  31.36 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  36.7 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 116 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 115 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 115 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 115 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>