More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11742 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  40.91 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  43.86 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  31.34 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  37.6 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  31.73 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 101 aa  72  0.000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 130 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  38.24 
 
 		 170 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.58 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.58 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.58 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  41.75 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.32 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  45.65 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.81 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  38.54 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  41.05 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  34.26 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  38.54 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>