More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2092 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 230 aa  274  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  43.54 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  38.6 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  33.49 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  32.82 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  32.58 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  44.32 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  30.51 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 116 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 116 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 113 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 126 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 111 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 111 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  42.22 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  44.94 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  38.82 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  28.04 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  42.05 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 113 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  45.35 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.7 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  33.88 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  36.26 
 
 		 107 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 107 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 107 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  62  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  38.37 
 
 		 160 aa  62  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  37.62 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  42.35 
 
 		 157 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  40.45 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 119 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  32.32 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 120 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>